RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 NARFQ9UHQ1 456 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SCN7AQ01118 1682 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF521Q96K83 1311 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ZPR1O75312 459 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 FKBP8Q14318 412 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 BCORQ6W2J9 1755 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WZG4 1122 aa14.7□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.7□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 ERBB4Q15303 1308 aa14.7□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 HOXB7P09629 217 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 PDIA6Q15084 440 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 MMP10P09238 476 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 MYL6BP14649 208 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 NECTIN2Q92692 538 aa14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 CAMTA2O94983 1202 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 PROSER3Q2NL68 480 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPYL6Q8N831 410 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 ANXA1P04083 346 aa14.67□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 TM4SF1P30408 202 aa14.67□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.67□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 DDR1Q08345 913 aa14.66□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 NFIXQ14938 502 aa14.66□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 SYT17Q9BSW7 474 aa14.66□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.66□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.65□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCL3L3-201ENST00000612839 NUP98P52948 1817 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA2Q08379 1002 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 KLHL34Q8N239 644 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 HLFQ16534 295 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 RGL2O15211 777 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 COPS6Q7L5N1 327 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 SLFN5Q08AF3 891 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 E9PSI1 815 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 VAMP4O75379 141 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 SERPINB2P05120 415 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 SETDB2Q96T68 719 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 HYPKQ9NX55 129 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP10DQ9P241 1426 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL3L3-201ENST00000612839 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 CACNA1FO60840 1977 aa14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.58□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 UTRNP46939 3433 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 STK31Q9BXU1 1019 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL3L3-201ENST00000612839 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms