RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603038.1

CHCHD2P3-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 pseudogene 3, humanhuman

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Gene CHCHD2P3, Length 451 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.61■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CHL1O00533 1208 aa20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PDIA6Q15084 440 aa20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CNBD1Q8NA66 436 aa20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ANXA1P04083 346 aa20.59■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PRELPP51888 382 aa20.59■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NECTIN2Q92692 538 aa20.59■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PDE6BP35913 854 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RASSF7Q02833 373 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PROSER3Q2NL68 480 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.58■□□□□ 0.89
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SBF1O95248 1867 aa20.58■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 APAF1O14727 1248 aa20.57■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NPHP1O15259 732 aa20.57■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.56■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NUP98P52948 1817 aa20.56■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.56■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.56■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.55■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SRGNP10124 158 aa20.55■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ST5P78524 1137 aa20.55■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RNF181Q9P0P0 153 aa20.55■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KIF3CO14782 793 aa20.54■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RGL2O15211 777 aa20.54■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 C21orf2O43822 256 aa20.54■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.54■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SLX4Q8IY92 1834 aa20.53■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GPTP24298 496 aa20.53■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NFKBIEO00221 500 aa20.52■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.52■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.52■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.52■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.52■□□□□ 0.88
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.52■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ERBB4Q15303 1308 aa20.52■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.52■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SUSD4Q5VX71 490 aa20.51■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 STYK1Q6J9G0 422 aa20.51■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MASTLQ96GX5 879 aa20.51■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ERFEQ4G0M1 354 aa20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 COPS6Q7L5N1 327 aa20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CFAP44Q96MT7 982 aa20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CACNA1SQ13698 1873 aa20.5■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF853P0CG23 659 aa20.49■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.49■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CNKSR1Q969H4 720 aa20.49■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MBIPQ9NS73 344 aa20.49■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ABCC12Q96J65 1359 aa20.48■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LMNB1P20700 586 aa20.48■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.48■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 OLFM4Q6UX06 510 aa20.47■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NPR1P16066 1061 aa20.46■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.46■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.46■□□□□ 0.87
CHCHD2P3-201ENST00000603038 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.45■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NTSR2O95665 410 aa20.45■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.45■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF428Q96B54 188 aa20.45■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.44■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NYXQ9GZU5 481 aa20.44■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RRAGCQ9HB90 399 aa20.44■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ANP32CO43423 234 aa20.43■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SYNE4Q8N205 404 aa20.43■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MRS2Q9HD23 443 aa20.43■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 IFT57Q9NWB7 429 aa20.43■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SLC51AQ86UW1 340 aa20.42■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.42■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GNAI1P63096 354 aa20.41■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TCIRG1Q13488 830 aa20.41■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CRY2Q49AN0 593 aa20.41■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 HOXB7P09629 217 aa20.4■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PARP10Q53GL7 1025 aa20.4■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.4■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.4■□□□□ 0.86
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.39■□□□□ 0.85
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GLTPD2A6NH11 291 aa20.39■□□□□ 0.85
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.39■□□□□ 0.85
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NLRP10Q86W26 655 aa20.39■□□□□ 0.85
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