RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	PROSER3	Q2NL68	480 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	IL16	Q14005	1332 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	NPHP1	O15259	732 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	HLF	Q16534	295 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	WDR63	Q8IWG1	891 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	29.3	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	RGL2	O15211	777 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	DPEP1	P16444	411 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	29.28	■■■□□ 2.28	5e-7	■■□□□ 12.9
TIMM44-208	ENST00000598968	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	29.28	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
TIMM44-208	ENST00000598968	COPS6	Q7L5N1	327 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	MIER1	Q8N108	512 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	CNBD1	Q8NA66	436 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	NUP98	P52948	1817 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM177B	A6PVY3	158 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	CHRNA5	P30532	468 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	TSPYL6	Q8N831	410 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	ST5	P78524	1137 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	KCNA3	P22001	575 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	HYPK	Q9NX55	129 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	PIM2	Q9P1W9	311 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	BCS1L	Q9Y276	419 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TIMM44-208	ENST00000598968	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	GPT	P24298	496 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968		H0YIN7	160 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	PDE6B	P35913	854 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	GOLGA2	Q08379	1002 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP10D	Q9P241	1426 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	YY1	P25490	414 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	NYX	Q9GZU5	481 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TIMM44-208	ENST00000598968	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	STK31	Q9BXU1	1019 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	SUSD4	Q5VX71	490 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	29.12	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF521	Q96K83	1311 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	CHD4	Q14839	1912 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	TCIRG1	Q13488	830 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	PARP10	Q53GL7	1025 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ERFE	Q4G0M1	354 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	TTLL6	Q8N841	843 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TIMM44-208	ENST00000598968	VAMP4	O75379	141 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	NTSR2	O95665	410 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC4A2	P04920	1241 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	SRGN	P10124	158 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	MASTL	Q96GX5	879 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	NLRP10	Q86W26	655 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968		E9PSI1	815 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	STYK1	Q6J9G0	422 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	CNKSR1	Q969H4	720 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ABCC12	Q96J65	1359 aa		29.02	■■■□□ 2.24

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