RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 POTEFA5A3E0 1075 aa15.93■□□□□ 0.14
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CAPNS1-209ENST00000590049 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.85■□□□□ 0.13
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CAPNS1-209ENST00000590049 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.81■□□□□ 0.12
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CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 TMC1Q8TDI8 760 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PP64 1363 aa15.79■□□□□ 0.12
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CAPNS1-209ENST00000590049 COL15A1P39059 1388 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC10A3P09131 477 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
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CAPNS1-209ENST00000590049 HTTP42858 3142 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR25O00155 361 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-209ENST00000590049 TBC1D8O95759 1140 aa15.77■□□□□ 0.12
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CAPNS1-209ENST00000590049 TJP1Q07157 1748 aa15.75■□□□□ 0.11
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 CENPFP49454 3210 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 LAMA3Q16787 3333 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-209ENST00000590049 NPHP1O15259 732 aa15.74■□□□□ 0.11
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