RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.41■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 NUP98P52948 1817 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 TTLL6Q8N841 843 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 NPHP1O15259 732 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 MYL6BP14649 208 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 ST5P78524 1137 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 HLFQ16534 295 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 NGEFQ8N5V2 710 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.39■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 APAF1O14727 1248 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 PDIA6Q15084 440 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC184Q52MB2 194 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 CFAP44Q96MT7 982 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 SBF1O95248 1867 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 ANP32CO43423 234 aa26.34■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.34■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GIPC1-211ENST00000589631 SRGNP10124 158 aa26.32■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 C1QTNF8P60827 252 aa26.32■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.32■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 STYK1Q6J9G0 422 aa26.32■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 HOXB7P09629 217 aa26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF853P0CG23 659 aa26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 CNKSR1Q969H4 720 aa26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 MASTLQ96GX5 879 aa26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.31■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 KRT24Q2M2I5 525 aa26.3■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 PROSER3Q2NL68 480 aa26.29■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 NYXQ9GZU5 481 aa26.29■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 FAM177BA6PVY3 158 aa26.28■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.28■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 MBIPQ9NS73 344 aa26.28■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 IFT57Q9NWB7 429 aa26.28■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 GNAI1P63096 354 aa26.27■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 NECTIN2Q92692 538 aa26.27■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 RNF181Q9P0P0 153 aa26.27■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.27■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 SLX4Q8IY92 1834 aa26.27■■□□□ 1.8
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.26■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 ANXA1P04083 346 aa26.26■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 MRS2Q9HD23 443 aa26.26■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 NPR1P16066 1061 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 COPS6Q7L5N1 327 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 CACNA1SQ13698 1873 aa26.25■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 C21orf2O43822 256 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 LMNB1P20700 586 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 GPTP24298 496 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 RASSF7Q02833 373 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.24■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC27Q2M243 656 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 PARP10Q53GL7 1025 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 SUSD4Q5VX71 490 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 NFKBIEO00221 500 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.22■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 ERFEQ4G0M1 354 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 SOGA3Q5TF21 947 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.21■■□□□ 1.79
GIPC1-211ENST00000589631 KIF3CO14782 793 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 PRELPP51888 382 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 CRY2Q49AN0 593 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 NTSR2O95665 410 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 ALDH1B1P30837 517 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC12Q96J65 1359 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 HYPKQ9NX55 129 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 TCIRG1Q13488 830 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms