RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF25Q93038 417 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 CABP1Q9NZU7 370 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 NID1P14543 1247 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 NEUROD1Q13562 356 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRE1Q14246 886 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 GRIK4Q16099 956 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-204ENST00000577468 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRM-204ENST00000577468 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRM-204ENST00000577468 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-204ENST00000577468 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2IP78347 998 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-204ENST00000577468 PSME1Q06323 249 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-204ENST00000577468 TYRO3Q06418 890 aa4.94□□□□□ -1.62
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