RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574070.5

CLDN7-207, Transcript of claudin 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLDN7, Length 485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-207ENST00000574070 PROSER3Q2NL68 480 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 SCN7AQ01118 1682 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 GOLGA2Q08379 1002 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 PDIA6Q15084 440 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 SETDB2Q96T68 719 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 NPHP1O15259 732 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 SERPINB2P05120 415 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 HSPA6P17066 643 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 TSPYL6Q8N831 410 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 COPS6Q7L5N1 327 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 BCORQ6W2J9 1755 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN7-207ENST00000574070 HLFQ16534 295 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.25■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 HYPKQ9NX55 129 aa22.25■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF521Q96K83 1311 aa22.25■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.25■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 ADCY9O60503 1353 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 FAM177BA6PVY3 158 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 RGL2O15211 777 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 STK31Q9BXU1 1019 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 E9PSI1 815 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 GPTP24298 496 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 TGFB2P61812 414 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 CNBD1Q8NA66 436 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN7-207ENST00000574070 ST5P78524 1137 aa22.2■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.2■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.19■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 A0A0G2JLW4 131 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 DPEP1P16444 411 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 VAMP4O75379 141 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 SLFN5Q08AF3 891 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 NUP98P52948 1817 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.16■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 SLC4A2P04920 1241 aa22.16■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 CHRNA5P30532 468 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 NYXQ9GZU5 481 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN7-207ENST00000574070 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.14■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 PDE6BP35913 854 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 TCIRG1Q13488 830 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 PARP10Q53GL7 1025 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 H0YIN7 160 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 SUSD4Q5VX71 490 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 BCS1LQ9Y276 419 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 PIM2Q9P1W9 311 aa22.11■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 APLP1P51693 650 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 G2E3Q7L622 706 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 ERFEQ4G0M1 354 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF428Q96B54 188 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 MYD88Q99836 296 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN7-207ENST00000574070 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.09■■□□□ 1.13
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