RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572936.5

MPDU1-211, Transcript of mannose-P-dolichol utilization defect 1, humanhuman

TSL 5

Gene MPDU1, Length 1,102 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPDU1-211ENST00000572936 PDE6BP35913 854 aa23.83■■□□□ 1.41
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MPDU1-211ENST00000572936 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.82■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 NBPF26B4DH59 902 aa23.82■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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MPDU1-211ENST00000572936 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
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MPDU1-211ENST00000572936 APLP1P51693 650 aa23.81■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 RASSF7Q02833 373 aa23.81■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.81■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 CHL1O00533 1208 aa23.8■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 CAMTA2O94983 1202 aa23.79■■□□□ 1.4
MPDU1-211ENST00000572936 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.79■■□□□ 1.4
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MPDU1-211ENST00000572936 CFAP44Q96MT7 982 aa23.76■■□□□ 1.39
MPDU1-211ENST00000572936 NUP98P52948 1817 aa23.75■■□□□ 1.39
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MPDU1-211ENST00000572936 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
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MPDU1-211ENST00000572936 FSTL1Q12841 308 aa23.74■■□□□ 1.39
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MPDU1-211ENST00000572936 C21orf2O43822 256 aa23.73■■□□□ 1.39
MPDU1-211ENST00000572936 CNKSR1Q969H4 720 aa23.73■■□□□ 1.39
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MPDU1-211ENST00000572936 GLTPD2A6NH11 291 aa23.71■■□□□ 1.39
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MPDU1-211ENST00000572936 ZNF853P0CG23 659 aa23.71■■□□□ 1.39
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MPDU1-211ENST00000572936 GNAI1P63096 354 aa23.7■■□□□ 1.38
MPDU1-211ENST00000572936 KRT24Q2M2I5 525 aa23.7■■□□□ 1.38
MPDU1-211ENST00000572936 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.7■■□□□ 1.38
MPDU1-211ENST00000572936 NGEFQ8N5V2 710 aa23.7■■□□□ 1.38
MPDU1-211ENST00000572936 MASTLQ96GX5 879 aa23.7■■□□□ 1.38
MPDU1-211ENST00000572936 MBIPQ9NS73 344 aa23.7■■□□□ 1.38
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MPDU1-211ENST00000572936 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.67■■□□□ 1.38
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MPDU1-211ENST00000572936 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.66■■□□□ 1.38
MPDU1-211ENST00000572936 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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MPDU1-211ENST00000572936 CCDC93Q567U6 631 aa23.59■■□□□ 1.37
MPDU1-211ENST00000572936 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.59■■□□□ 1.37
MPDU1-211ENST00000572936 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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MPDU1-211ENST00000572936 COPS6Q7L5N1 327 aa23.58■■□□□ 1.37
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