RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566269.6

MSLN-206, Transcript of mesothelin, humanhuman

TSL 3

Gene MSLN, Length 1,068 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-206ENST00000566269 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.96■■□□□ 1.27
MSLN-206ENST00000566269 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MSLN-206ENST00000566269 CCDC27Q2M243 656 aa22.95■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 PROSER3Q2NL68 480 aa22.95■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.95■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 HOXB7P09629 217 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 CHRNA5P30532 468 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 PDIA6Q15084 440 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 HLFQ16534 295 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 WWC1Q8IX03 1113 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 CNBD1Q8NA66 436 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 BCS1LQ9Y276 419 aa22.94■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 RGL2O15211 777 aa22.93■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.93■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.93■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 NUP98P52948 1817 aa22.93■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.91■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 ST5P78524 1137 aa22.91■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 PIM2Q9P1W9 311 aa22.91■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.91■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.91■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 FAM177BA6PVY3 158 aa22.9■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 KCNA3P22001 575 aa22.9■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.9■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
MSLN-206ENST00000566269 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.89■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 ATP10DQ9P241 1426 aa22.89■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.89■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.88■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 IL16Q14005 1332 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 H0YIN7 160 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 GPTP24298 496 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 PDE6BP35913 854 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 COPS6Q7L5N1 327 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.87■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.85■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.83■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 WDR63Q8IWG1 891 aa22.83■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 NYXQ9GZU5 481 aa22.83■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 HYPKQ9NX55 129 aa22.83■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.83■■□□□ 1.25
MSLN-206ENST00000566269 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.83■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.82■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 CCER2I3L3R5 266 aa22.82■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.82■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 TSPYL6Q8N831 410 aa22.82■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.81■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 TTLL6Q8N841 843 aa22.81■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.8■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.8■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ABCC12Q96J65 1359 aa22.79■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 PARP10Q53GL7 1025 aa22.79■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.79■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.79■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 CACNA1SQ13698 1873 aa22.79■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ERFEQ4G0M1 354 aa22.78■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 SUSD4Q5VX71 490 aa22.78■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 NTSR2O95665 410 aa22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 GOLGA2Q08379 1002 aa22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.77■■□□□ 1.24
MSLN-206ENST00000566269 SRGNP10124 158 aa22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 MASTLQ96GX5 879 aa22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 STK31Q9BXU1 1019 aa22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 TCIRG1Q13488 830 aa22.75■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 STYK1Q6J9G0 422 aa22.75■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 CNKSR1Q969H4 720 aa22.75■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 NPR1P16066 1061 aa22.74■■□□□ 1.23
MSLN-206ENST00000566269 NLRP10Q86W26 655 aa22.74■■□□□ 1.23
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