RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 ZNF853P0CG23 659 aa24.58■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.58■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.58■■□□□ 1.53
USP10-208ENST00000563386 FAM177BA6PVY3 158 aa24.57■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 PROSER3Q2NL68 480 aa24.57■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.57■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 PDIA6Q15084 440 aa24.56■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.56■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 WWC1Q8IX03 1113 aa24.56■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 CNBD1Q8NA66 436 aa24.56■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 PIM2Q9P1W9 311 aa24.56■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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USP10-208ENST00000563386 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.55■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.55■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.55■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 CCDC27Q2M243 656 aa24.54■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.54■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 CHD4Q14839 1912 aa24.53■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.53■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.53■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 ST5P78524 1137 aa24.52■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
USP10-208ENST00000563386 H0YIN7 160 aa24.51■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 HOXB7P09629 217 aa24.51■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 GPTP24298 496 aa24.51■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.51■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 RGL2O15211 777 aa24.5■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 COPS6Q7L5N1 327 aa24.5■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.5■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.5■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.5■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 UTRNP46939 3433 aa24.49■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 PDE6BP35913 854 aa24.49■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.49■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.49■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 NUP98P52948 1817 aa24.49■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.47■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
USP10-208ENST00000563386 IL16Q14005 1332 aa24.45■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ATP10DQ9P241 1426 aa24.44■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 TSPYL6Q8N831 410 aa24.44■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 TTLL6Q8N841 843 aa24.44■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 HYPKQ9NX55 129 aa24.44■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.43■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.43■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 WDR63Q8IWG1 891 aa24.43■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.43■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 NYXQ9GZU5 481 aa24.43■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 SUSD4Q5VX71 490 aa24.42■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.42■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.42■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ERFEQ4G0M1 354 aa24.41■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.4■■□□□ 1.5
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USP10-208ENST00000563386 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.4■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 ZNF428Q96B54 188 aa24.4■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.39■■□□□ 1.5
USP10-208ENST00000563386 CCER2I3L3R5 266 aa24.39■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 PARP10Q53GL7 1025 aa24.39■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.39■■□□□ 1.49
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USP10-208ENST00000563386 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.39■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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USP10-208ENST00000563386 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.38■■□□□ 1.49
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USP10-208ENST00000563386 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.38■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 TCIRG1Q13488 830 aa24.37■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 STYK1Q6J9G0 422 aa24.37■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 ABCC12Q96J65 1359 aa24.37■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 NTSR2O95665 410 aa24.36■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.36■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 CNKSR1Q969H4 720 aa24.36■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
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USP10-208ENST00000563386 C21orf2O43822 256 aa24.35■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 NPR1P16066 1061 aa24.35■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 GOLGA2Q08379 1002 aa24.35■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 NLRP10Q86W26 655 aa24.35■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 STK31Q9BXU1 1019 aa24.35■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
USP10-208ENST00000563386 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.34■■□□□ 1.49
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