RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-208	ENST00000548896	ZBBX	A8MT70	800 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	HFM1	A2PYH4	1435 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	NWD1	Q149M9	1564 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	MEIOB	Q8N635	442 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	FBXO45	P0C2W1	286 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	UPP2	O95045	317 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ADGRB3	O60242	1522 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ZFYVE9	O95405	1425 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	WFS1	O76024	890 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	BMP2	P12643	396 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896		Q6ZVU0	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HECTD4-208	ENST00000548896	ESPN	B1AK53	854 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	APBB1	O00213	710 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	GPR37L1	O60883	481 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	CBLB	Q13191	982 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	NAIP	Q13075	1403 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	RAB15	P59190	212 aa		12	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	NR1H3	Q13133	447 aa		12	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		12	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	ATF3	P18847	181 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	RXRB	P28702	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	UNC13B	O14795	1591 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	DCC	P43146	1447 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HECTD4-208	ENST00000548896	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		11.96	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.96	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	MAN1A2	O60476	641 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	LILRA1	O75019	489 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	NUP155	O75694	1391 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	SPINT1	O43278	529 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	LCE2C	Q5TA81	110 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	BRINP3	Q76B58	766 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	LRP6	O75581	1613 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	VEGFB	P49765	207 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	RELB	Q01201	579 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HECTD4-208	ENST00000548896	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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