RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 GRIN3BO60391 1043 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ITPK1Q13572 414 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC184Q52MB2 194 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MBIPQ9NS73 344 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF827Q17R98 1081 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 WWC1Q8IX03 1113 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-206ENST00000548122 ALS2Q96Q42 1657 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 GORABQ5T7V8 394 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 WDR63Q8IWG1 891 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-206ENST00000548122 VPS37DQ86XT2 251 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 APBB1O00213 710 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PLIN1O60240 522 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 JDP2Q8WYK2 163 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NCAPD2Q15021 1401 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 C6orf229H3BNL8 230 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-206ENST00000548122 PIM2Q9P1W9 311 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NARFQ9UHQ1 456 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 GLI3P10071 1580 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 KRT24Q2M2I5 525 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PARP10Q53GL7 1025 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CNKSR1Q969H4 720 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 COL15A1P39059 1388 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 AKAP12Q02952 1782 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 YY1P25490 414 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 KDRP35968 1356 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 BCL9O00512 1426 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0G2JLW4 131 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC6O95255 1503 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ALDH1B1P30837 517 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 TTLL6Q8N841 843 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRB-206ENST00000548122 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 DISP2A7MBM2 1401 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NFIXQ14938 502 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PROM2Q8N271 834 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 SYT17Q9BSW7 474 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 LTN1O94822 1766 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ERBB4Q15303 1308 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 CHL1O00533 1208 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 HOXB7P09629 217 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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