RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 APAF1O14727 1248 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 PDE6BP35913 854 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC184Q52MB2 194 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NGEFQ8N5V2 710 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 H0YIN7 160 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NPHP1O15259 732 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 MYL6BP14649 208 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ST5P78524 1137 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 HLFQ16534 295 aa22.11■■□□□ 1.13
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HOXD8-204ENST00000544999 ATP10DQ9P241 1426 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXD8-204ENST00000544999 CFAP44Q96MT7 982 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NUP98P52948 1817 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXD8-204ENST00000544999 TTLL6Q8N841 843 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 PDIA6Q15084 440 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.07■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 MBIPQ9NS73 344 aa22.04■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 SRGNP10124 158 aa22.03■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 STYK1Q6J9G0 422 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 NECTIN2Q92692 538 aa22.03■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 FAM177BA6PVY3 158 aa22.02■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 CNKSR1Q969H4 720 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 MASTLQ96GX5 879 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 SBF1O95248 1867 aa22.02■■□□□ 1.12
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HOXD8-204ENST00000544999 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
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HOXD8-204ENST00000544999 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 CACNA1SQ13698 1873 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 NPR1P16066 1061 aa21.98■■□□□ 1.11
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HOXD8-204ENST00000544999 RNF181Q9P0P0 153 aa21.98■■□□□ 1.11
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HOXD8-204ENST00000544999 SLX4Q8IY92 1834 aa21.97■■□□□ 1.11
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HOXD8-204ENST00000544999 NTSR2O95665 410 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 ERFEQ4G0M1 354 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 NFKBIEO00221 500 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 LMNB1P20700 586 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 SOGA3Q5TF21 947 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 WWC1Q8IX03 1113 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 HYPKQ9NX55 129 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 PRELPP51888 382 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 TCIRG1Q13488 830 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 CRY2Q49AN0 593 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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