RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540468.5

CCT7-216, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCT7, Length 1,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7-216ENST00000540468 NBPF15Q8N660 670 aa20.29■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.29■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 STARD3NLO95772 234 aa20.28■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 PROSER3Q2NL68 480 aa20.28■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.28■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.27■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 ANXA1P04083 346 aa20.27■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 PDIA6Q15084 440 aa20.27■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.27■□□□□ 0.84
CCT7-216ENST00000540468 AKT1S1Q96B36 256 aa20.26■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.26■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 GCC1Q96CN9 775 aa20.26■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 CACNA1FO60840 1977 aa20.24■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.24■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.24■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 SOCS7O14512 581 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 GNPATO15228 680 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 MYL6BP14649 208 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 NUCB1Q02818 461 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 AK7Q96M32 723 aa20.22■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 RPS6KA4O75676 772 aa20.21■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.21■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 C4AP0C0L4 1744 aa20.21■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 ERBB4Q15303 1308 aa20.21■□□□□ 0.83
CCT7-216ENST00000540468 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 SLC15A2Q16348 729 aa20.2■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 G2E3Q7L622 706 aa20.2■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.2■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 PHF14O94880 888 aa20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 FLIIQ13045 1269 aa20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 STK32BQ9NY57 414 aa20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.18■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 COL15A1P39059 1388 aa20.17■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.17■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.17■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.17■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 COPS6Q7L5N1 327 aa20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 HYPKQ9NX55 129 aa20.16■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 SSFA2P28290 1259 aa20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 ATP10DQ9P241 1426 aa20.15■□□□□ 0.82
CCT7-216ENST00000540468 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 BCORQ6W2J9 1755 aa20.14■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 F6X3S4 739 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 MEIS3Q99687 375 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 CEP85Q6P2H3 762 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 LNPKQ9C0E8 428 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 DCTPP1Q9H773 170 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 SCN7AQ01118 1682 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 NUP98P52948 1817 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 ARXQ96QS3 562 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 HMMRO75330 724 aa20.11■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 CAMTA2O94983 1202 aa20.11■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 GNAI3P08754 354 aa20.11■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 ADRA2BP18089 450 aa20.11■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 CASZ1Q86V15 1759 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 GNAI2P04899 355 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 RFC4P35249 363 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 HLFQ16534 295 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 NARFQ9UHQ1 456 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 ADCY9O60503 1353 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCT7-216ENST00000540468 A0A087WZG4 1122 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms