RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC184Q52MB2 194 aa18.35■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 ERBB4Q15303 1308 aa18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 H0YIN7 160 aa18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 APAF1O14727 1248 aa18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 ANP32CO43423 234 aa18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
BRMS1-209ENST00000534617 PDE6BP35913 854 aa18.33■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 HLFQ16534 295 aa18.33■□□□□ 0.52
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BRMS1-209ENST00000534617 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.33■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 FAM177BA6PVY3 158 aa18.32■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 CHL1O00533 1208 aa18.32■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 RGL2O15211 777 aa18.32■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 KRT24Q2M2I5 525 aa18.32■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 NECTIN2Q92692 538 aa18.32■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 NUP98P52948 1817 aa18.32■□□□□ 0.52
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BRMS1-209ENST00000534617 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
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BRMS1-209ENST00000534617 CACNA1SQ13698 1873 aa18.31■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 ANXA1P04083 346 aa18.3■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 MRS2Q9HD23 443 aa18.3■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.3■□□□□ 0.52
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BRMS1-209ENST00000534617 PROSER3Q2NL68 480 aa18.29■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 CFAP44Q96MT7 982 aa18.28■□□□□ 0.52
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BRMS1-209ENST00000534617 GPTP24298 496 aa18.27■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 RASSF7Q02833 373 aa18.27■□□□□ 0.52
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BRMS1-209ENST00000534617 PDIA6Q15084 440 aa18.27■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.27■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.27■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 MBIPQ9NS73 344 aa18.27■□□□□ 0.52
BRMS1-209ENST00000534617 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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BRMS1-209ENST00000534617 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.26■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 RNF181Q9P0P0 153 aa18.26■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.25■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 NYXQ9GZU5 481 aa18.25■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 IFT57Q9NWB7 429 aa18.25■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.25■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC12Q96J65 1359 aa18.25■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.24■□□□□ 0.51
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BRMS1-209ENST00000534617 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.24■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 MASTLQ96GX5 879 aa18.24■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 C21orf2O43822 256 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF853P0CG23 659 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 C1QTNF8P60827 252 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 COPS6Q7L5N1 327 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 CNKSR1Q969H4 720 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 SLX4Q8IY92 1834 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.23■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 NFKBIEO00221 500 aa18.21■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 NPR1P16066 1061 aa18.21■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 ERFEQ4G0M1 354 aa18.21■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 SUSD4Q5VX71 490 aa18.21■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.21■□□□□ 0.51
BRMS1-209ENST00000534617 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.2■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 NTSR2O95665 410 aa18.2■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 LMNB1P20700 586 aa18.2■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 PRELPP51888 382 aa18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 PARP10Q53GL7 1025 aa18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.19■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.18■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC27Q2M243 656 aa18.17■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 SOGA3Q5TF21 947 aa18.17■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 WWC1Q8IX03 1113 aa18.16■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.16■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.16■□□□□ 0.5
BRMS1-209ENST00000534617 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.16■□□□□ 0.5
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