RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	MRS2	Q9HD23	443 aa		43.11	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	ST5	P78524	1137 aa		43.1	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	43.1	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	ERBB4	Q15303	1308 aa		43.1	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	RGL2	O15211	777 aa		43.09	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	PDE6B	P35913	854 aa		43.09	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		43.09	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	HLF	Q16534	295 aa		43.08	■■■■■ 4.49
LRP4-205	ENST00000534404	CFAP44	Q96MT7	982 aa		43.06	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		43.05	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	NECTIN2	Q92692	538 aa		43.05	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		43.05	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		43.04	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		43.04	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	FAM177B	A6PVY3	158 aa		43.03	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		43.03	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	KRT24	Q2M2I5	525 aa		43.02	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		43.02	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	TTLL6	Q8N841	843 aa		43.02	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	43.02	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		43.02	■■■■■ 4.48
LRP4-205	ENST00000534404	ATP10D	Q9P241	1426 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	PDIA6	Q15084	440 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	MBIP	Q9NS73	344 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	ANXA1	P04083	346 aa		42.97	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	GNAI1	P63096	354 aa		42.96	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	IFT57	Q9NWB7	429 aa		42.96	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	PROSER3	Q2NL68	480 aa		42.95	■■■■■ 4.47
LRP4-205	ENST00000534404	ADCY9	O60503	1353 aa		42.94	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		42.94	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		42.93	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF853	P0CG23	659 aa		42.92	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	HOXB7	P09629	217 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	GPT	P24298	496 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	NYX	Q9GZU5	481 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	NUP98	P52948	1817 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	42.9	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		42.89	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	COPS6	Q7L5N1	327 aa		42.89	■■■■■ 4.46
LRP4-205	ENST00000534404	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		42.88	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	MASTL	Q96GX5	879 aa		42.88	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		42.88	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	SRGN	P10124	158 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	STYK1	Q6J9G0	422 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	CNKSR1	Q969H4	720 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		42.83	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		42.83	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	RNF181	Q9P0P0	153 aa		42.83	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		42.82	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC27	Q2M243	656 aa		42.82	■■■■■ 4.45
LRP4-205	ENST00000534404	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	C21orf2	O43822	256 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	RASSF7	Q02833	373 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	SUSD4	Q5VX71	490 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	NPR1	P16066	1061 aa		42.8	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		42.8	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	ERFE	Q4G0M1	354 aa		42.79	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	PARP10	Q53GL7	1025 aa		42.79	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	WWC1	Q8IX03	1113 aa		42.79	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		42.79	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		42.78	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	HYPK	Q9NX55	129 aa		42.76	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
LRP4-205	ENST00000534404	ABCC12	Q96J65	1359 aa		42.74	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		42.73	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	CACNA1S	Q13698	1873 aa		42.72	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	NTSR2	O95665	410 aa		42.72	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	LMNB1	P20700	586 aa		42.72	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	C1QTNF8	P60827	252 aa		42.72	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		42.71	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	ALDH1B1	P30837	517 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	TCIRG1	Q13488	830 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	SOGA3	Q5TF21	947 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	SLX4	Q8IY92	1834 aa		42.69	■■■■■ 4.43
LRP4-205	ENST00000534404	NFKBIE	O00221	500 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	SBF1	O95248	1867 aa		42.68	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42

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