RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.42	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	GPR162	Q16538	588 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	MIER1	Q8N108	512 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	ANXA1	P04083	346 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	NPHP1	O15259	732 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	HLF	Q16534	295 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.37	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751		A0A0G2JLW4	131 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	DPEP1	P16444	411 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PTPRK-222	ENST00000532751	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	ST5	P78524	1137 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF521	Q96K83	1311 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	CHD4	Q14839	1912 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.29	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	STK31	Q9BXU1	1019 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	PDE6B	P35913	854 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PTPRK-222	ENST00000532751	GPT	P24298	496 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	CHRNA5	P30532	468 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751		H0YIN7	160 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	KCNA3	P22001	575 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751		E9PSI1	815 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PTPRK-222	ENST00000532751	VAMP4	O75379	141 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	NTSR2	O95665	410 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC4A2	P04920	1241 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.17	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	ERFE	Q4G0M1	354 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	YY1	P25490	414 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.15	■■■□□ 2.1

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