RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527920.5

SSSCA1-205, Transcript of Sjogren syndrome/scleroderma autoantigen 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SSSCA1, Length 806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSSCA1-205	ENST00000527920	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	CFAP44	Q96MT7	982 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	ST5	P78524	1137 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	ATP10D	Q9P241	1426 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	43.14	■■■■■ 4.5
SSSCA1-205	ENST00000527920	MYL6B	P14649	208 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	HLF	Q16534	295 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	43.13	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	NPHP1	O15259	732 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	TTLL6	Q8N841	843 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	HOXB7	P09629	217 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	PDIA6	Q15084	440 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	NGEF	Q8N5V2	710 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		43.1	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF853	P0CG23	659 aa		43.07	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		43.07	■■■■■ 4.49
SSSCA1-205	ENST00000527920	MRS2	Q9HD23	443 aa		43.06	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	IFT57	Q9NWB7	429 aa		43.06	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	KRT24	Q2M2I5	525 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	GNAI1	P63096	354 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	MBIP	Q9NS73	344 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	PROSER3	Q2NL68	480 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	STYK1	Q6J9G0	422 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
SSSCA1-205	ENST00000527920	SRGN	P10124	158 aa		43	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	42.99	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	NYX	Q9GZU5	481 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	NUP98	P52948	1817 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	CCDC27	Q2M243	656 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	CNKSR1	Q969H4	720 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	MASTL	Q96GX5	879 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		42.96	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		42.96	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	ANXA1	P04083	346 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	NECTIN2	Q92692	538 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SSSCA1-205	ENST00000527920	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	FAM177B	A6PVY3	158 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	NPR1	P16066	1061 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	PARP10	Q53GL7	1025 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	COPS6	Q7L5N1	327 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	GPT	P24298	496 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SSSCA1-205	ENST00000527920	RNF181	Q9P0P0	153 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	C1QTNF8	P60827	252 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	ABCC12	Q96J65	1359 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	SUSD4	Q5VX71	490 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	WWC1	Q8IX03	1113 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	NFKBIE	O00221	500 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	LMNB1	P20700	586 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	RASSF7	Q02833	373 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	SOGA3	Q5TF21	947 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	C21orf2	O43822	256 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	NTSR2	O95665	410 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	CRY2	Q49AN0	593 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	HYPK	Q9NX55	129 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	ERFE	Q4G0M1	354 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	SBF1	O95248	1867 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SSSCA1-205	ENST00000527920	IL16	Q14005	1332 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	SLX4	Q8IY92	1834 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	TCIRG1	Q13488	830 aa		42.78	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	ALDH1B1	P30837	517 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	PRELP	P51888	382 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SSSCA1-205	ENST00000527920	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44

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