RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.32■■■■□ 3.09
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TSPAN4-217ENST00000527644 HLFQ16534 295 aa34.32■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 KRT24Q2M2I5 525 aa34.32■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
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TSPAN4-217ENST00000527644 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.32■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 MBIPQ9NS73 344 aa34.32■■■■□ 3.08
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TSPAN4-217ENST00000527644 H0YIN7 160 aa34.29■■■■□ 3.08
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TSPAN4-217ENST00000527644 ST5P78524 1137 aa34.29■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC27Q2M243 656 aa34.29■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 LRP10Q7Z4F1 713 aa34.29■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
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TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
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TSPAN4-217ENST00000527644 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.26■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.26■■■■□ 3.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.25■■■■□ 3.07
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TSPAN4-217ENST00000527644 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.24■■■■□ 3.07
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TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.23■■■■□ 3.07
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TSPAN4-217ENST00000527644 WWC1Q8IX03 1113 aa34.23■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP10DQ9P241 1426 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 TTLL6Q8N841 843 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 NUP98P52948 1817 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.2■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 COPS6Q7L5N1 327 aa34.2■■■■□ 3.07
TSPAN4-217ENST00000527644 CHPF2Q9P2E5 772 aa34.19■■■■□ 3.06
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM177BA6PVY3 158 aa34.18■■■■□ 3.06
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM9BQ8IZU0 186 aa34.18■■■■□ 3.06
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TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
TSPAN4-217ENST00000527644 NYXQ9GZU5 481 aa34.18■■■■□ 3.06
TSPAN4-217ENST00000527644 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.17■■■■□ 3.06
TSPAN4-217ENST00000527644 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
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TSPAN4-217ENST00000527644 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
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TSPAN4-217ENST00000527644 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.01■■■■□ 3.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34■■■■□ 3.03
TSPAN4-217ENST00000527644 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ALDH1B1P30837 517 aa33.99■■■■□ 3.03
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TSPAN4-217ENST00000527644 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TSPAN4-217ENST00000527644 SOGA3Q5TF21 947 aa33.99■■■■□ 3.03
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