RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525939.1

ABCA7-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 7, human

TSL 3

Gene ABCA7, Length 374 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA7-208	ENST00000525939	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.86	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	KCNA3	P22001	575 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ABCA7-208	ENST00000525939		A0A0G2JLW4	131 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	DPEP1	P16444	411 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	HLF	Q16534	295 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		28.79	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.79	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.79	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	ANXA1	P04083	346 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ABCA7-208	ENST00000525939	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF521	Q96K83	1311 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	CHRNA5	P30532	468 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	PDE6B	P35913	854 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	ST5	P78524	1137 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	YY1	P25490	414 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		28.7	■■■□□ 2.19
ABCA7-208	ENST00000525939		H0YIN7	160 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	NPHP1	O15259	732 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	GPT	P24298	496 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	SRGN	P10124	158 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ABCA7-208	ENST00000525939	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.64	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	NTSR2	O95665	410 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	MIER1	Q8N108	512 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	SBF1	O95248	1867 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	VAMP4	O75379	141 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
ABCA7-208	ENST00000525939	ERFE	Q4G0M1	354 aa		28.59	■■■□□ 2.17

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