RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522574.5

TNIP1-215, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, human

TSL 2

Gene TNIP1, Length 1,394 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNIP1-215	ENST00000522574	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNIP1-215	ENST00000522574	ARX	Q96QS3	562 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNIP1-215	ENST00000522574	NARF	Q9UHQ1	456 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNIP1-215	ENST00000522574	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TNIP1-215	ENST00000522574	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ZPR1	O75312	459 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	COL15A1	P39059	1388 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	PLIN1	O60240	522 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	CAMTA2	O94983	1202 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	TRIM27	P14373	513 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	PHF14	O94880	888 aa		12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	TCIRG1	Q13488	830 aa		12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	CACNA1F	O60840	1977 aa		12	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ADCY9	O60503	1353 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	RREB1	Q92766	1687 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574		F6X3S4	739 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	HLF	Q16534	295 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ABCC4	O15439	1325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	MSH5	O43196	834 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	GYS1	P13807	737 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	RLBP1	P12271	317 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	MYD88	Q99836	296 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNIP1-215	ENST00000522574	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	TM4SF1	P30408	202 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	FKBP8	Q14318	412 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	GCKR	Q14397	625 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574		H7C1W4	665 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	GPT	P24298	496 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	NFIX	Q14938	502 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNIP1-215	ENST00000522574	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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