RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFT43Q96FT9 208 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XAGE2Q96GT9 111 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRELD1Q96HD1 420 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CABP1Q9NZU7 370 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POTEMA6NI47 508 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCSK2P16519 638 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOS2P35228 1153 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C8orf34Q49A92 452 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR152Q8TDT2 470 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNKSR1Q969H4 720 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A6NHS1 94 aa7.27□□□□□ -1.25
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARID5AQ03989 594 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TEAD4Q15561 434 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTN1Q16799 776 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POTEAQ6S8J7 498 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP48Q86UV5 1035 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBPF15Q8N660 670 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC16Q8NEE8 873 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GMLQ99445 158 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPG7Q9UQ90 795 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF223E7ERA6 249 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPLAHO14841 1288 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TREML1Q86YW5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARMC5Q96C12 935 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRMD6Q96NE9 622 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADH1CP00326 375 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEFLP07196 543 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLDC2A0PJX2 215 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NR3C2P08235 984 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NR5A1Q13285 461 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIF1Q9H611 641 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGT7Q9UJ14 662 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPCQ03188 943 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PI16Q6UXB8 463 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS37DQ86XT2 251 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEN1O00255 615 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADH1AP07327 375 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLN3Q13286 438 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LHX8Q68G74 356 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPNDQ8N594 471 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C12orf49Q9H741 205 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIAH2O43255 324 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPIAP49247 311 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CBLBQ13191 982 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IRS1P35568 1242 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGCXP38435 758 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TXLNAP40222 546 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDE2Q6IQ49 451 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLRP3Q96P20 1036 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCS1LQ9Y276 419 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MICAL2O94851 1124 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOGA3Q5TF21 947 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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