RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516123.1

SNORD116-28-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-28, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-28, Length 91 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-28-201ENST00000516123 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 IL27Q8NEV9 243 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 MDFIQ99750 246 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 LILRB5O75023 590 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 ADGRE1Q14246 886 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 MBTPS1Q14703 1052 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SNRKQ9NRH2 765 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 NID1P14543 1247 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SPEM2Q0P670 501 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 NEUROD2Q15784 382 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 PARP3Q9Y6F1 533 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TXLNAP40222 546 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SEMA3FQ13275 785 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 L3MBTL2Q969R5 705 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TP53INP1Q96A56 240 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC30A3Q99726 388 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 USP21Q9UK80 565 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SOX11P35716 441 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 PSME1Q06323 249 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TEAD4Q15561 434 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 WASHC4Q2M389 1173 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 EML3Q32P44 896 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 USP3Q9Y6I4 520 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 A0A0A0MRY4 1105 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 EML1O00423 815 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SELPP16109 830 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 NOS2P35228 1153 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 VAC14Q08AM6 782 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 CEP63Q96MT8 703 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 KCNH4Q9UQ05 1017 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 NOD1Q9Y239 953 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 SERTM1A2A2V5 107 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 PAX4O43316 350 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 IRF5Q13568 498 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 MCTP1Q6DN14 999 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 BRD7Q9NPI1 651 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD116-28-201ENST00000516123 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 TXKP42681 527 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 KCNQ4P56696 695 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 GTF2IP78347 998 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 BHMTQ93088 406 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 EFCC1Q9HA90 598 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF358Q9NW07 568 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 RNF112Q9ULX5 631 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 IGFLR1Q9H665 355 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 ABL2P42684 1182 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 HIF1AQ16665 826 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 NUDT8Q8WV74 236 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SFI1A8K8P3 1242 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 COBLO75128 1261 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SKIP12755 728 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 TYRO3Q06418 890 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCSK7Q16549 785 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC51AQ86UW1 340 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRIM50Q86XT4 487 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 PNMA5Q96PV4 448 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 TBCELQ5QJ74 424 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD116-28-201ENST00000516123 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms