RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 PROSER3Q2NL68 480 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 TGFB2P61812 414 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 GOLGA2Q08379 1002 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 NPHP1O15259 732 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 BCORQ6W2J9 1755 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 HLFQ16534 295 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 GPR162Q16538 588 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 COPS6Q7L5N1 327 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 HYPKQ9NX55 129 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 TSPYL6Q8N831 410 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF521Q96K83 1311 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 CNBD1Q8NA66 436 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 STK31Q9BXU1 1019 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 A0A0G2JLW4 131 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 ST5P78524 1137 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 DPEP1P16444 411 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.03■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 ATP10DQ9P241 1426 aa23.03■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 E9PSI1 815 aa23.03■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.03■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 FAM177BA6PVY3 158 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 GPTP24298 496 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 PDE6BP35913 854 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 NYXQ9GZU5 481 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-215ENST00000514625 GRIN3BO60391 1043 aa23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 PARP10Q53GL7 1025 aa23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 H0YIN7 160 aa23■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 VAMP4O75379 141 aa23■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC24Q8N4L8 307 aa23■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 PIM2Q9P1W9 311 aa23■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 NUP98P52948 1817 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 CHRNA5P30532 468 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 TCIRG1Q13488 830 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 SLC4A2P04920 1241 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 KCNA3P22001 575 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 SLFN5Q08AF3 891 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 BCS1LQ9Y276 419 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 SUSD4Q5VX71 490 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-215ENST00000514625 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 NLRP10Q86W26 655 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 NTSR2O95665 410 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 ERFEQ4G0M1 354 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 TTLL6Q8N841 843 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 KSR2Q6VAB6 950 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 FLIIQ13045 1269 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 MASTLQ96GX5 879 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-215ENST00000514625 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-215ENST00000514625 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-215ENST00000514625 SRGNP10124 158 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms