RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
ALYREF-203ENST00000511412 CACNA1SQ13698 1873 aa32.59■■■□□ 2.81
ALYREF-203ENST00000511412 LMNB1P20700 586 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-203ENST00000511412 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-203ENST00000511412 RGL2O15211 777 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 CEP350Q5VT06 3117 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 NFKBIEO00221 500 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 C21orf2O43822 256 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 PRELPP51888 382 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 STYK1Q6J9G0 422 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-203ENST00000511412 SRGNP10124 158 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 CNKSR1Q969H4 720 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 SLX4Q8IY92 1834 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 MASTLQ96GX5 879 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 RIPK4P57078 832 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 RRAGCQ9HB90 399 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 HLFQ16534 295 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 NGEFQ8N5V2 710 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 TSPYL4Q9UJ04 414 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 LMOD3Q0VAK6 560 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 NUP98P52948 1817 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 FAM177BA6PVY3 158 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 APLP1P51693 650 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-203ENST00000511412 GLTPD2A6NH11 291 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 SOGA3Q5TF21 947 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 TAOK3Q9H2K8 898 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 LTBP3Q9NS15 1303 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.43■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 MYL6BP14649 208 aa32.43■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 TMPOP42166 694 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 ERBB4Q15303 1308 aa32.43■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 NPR1P16066 1061 aa32.42■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 WDR90Q96KV7 1748 aa32.4■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 FSTL1Q12841 308 aa32.4■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 TTLL7Q6ZT98 887 aa32.4■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 ERFEQ4G0M1 354 aa32.39■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 NYXQ9GZU5 481 aa32.39■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 BABAM1Q9NWV8 329 aa32.39■■■□□ 2.78
ALYREF-203ENST00000511412 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP32.38■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC146Q8IYE0 955 aa32.38■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.37■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC12Q96J65 1359 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC93Q567U6 631 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 DPY19L2Q6NUT2 758 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 NEUROD2Q15784 382 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 SMC1BQ8NDV3 1235 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 C7orf43Q8WVR3 580 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 RUNDC1Q96C34 613 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-203ENST00000511412 GPTP24298 496 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 ALDH1B1P30837 517 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 PDIA6Q15084 440 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 CRY2Q49AN0 593 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 SUSD4Q5VX71 490 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS8Q9UP79 889 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-203ENST00000511412 PROSER3Q2NL68 480 aa32.26■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 RTKN2Q8IZC4 609 aa32.26■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM35Q9UPQ4 493 aa32.26■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 POTECB2RU33 542 aa32.25■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 NTSR2O95665 410 aa32.25■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 ANXA1P04083 346 aa32.25■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 PARP10Q53GL7 1025 aa32.25■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 OLFM4Q6UX06 510 aa32.25■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 CHL1O00533 1208 aa32.24■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.24■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa32.23■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 NECTIN2Q92692 538 aa32.23■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 DDNO94850 711 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
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