RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEUROD2Q15784 382 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NGEFQ8N5V2 710 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNKSR1Q969H4 720 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF181Q9P0P0 153 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRGNP10124 158 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLFQ16534 295 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STYK1Q6J9G0 422 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCORQ6W2J9 1755 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHL1O00533 1208 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYL6BP14649 208 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MASTLQ96GX5 879 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF3CO14782 793 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LMNB1P20700 586 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NYXQ9GZU5 481 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOGA3Q5TF21 947 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C21orf2O43822 256 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPR1P16066 1061 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASSF7Q02833 373 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM177BA6PVY3 158 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDIA6Q15084 440 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NFKBIEO00221 500 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOMM70O94826 608 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP44Q96MT7 982 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LTBP3Q9NS15 1303 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APAF1O14727 1248 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXB7P09629 217 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALDH1B1P30837 517 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRELPP51888 382 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PARP10Q53GL7 1025 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAOK3Q9H2K8 898 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLTPD2A6NH11 291 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSPA6P17066 643 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPTP24298 496 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PROSER3Q2NL68 480 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C7orf43Q8WVR3 580 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SBF1O95248 1867 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRY2Q49AN0 593 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERFEQ4G0M1 354 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUSD4Q5VX71 490 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPY19L2Q6NUT2 758 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COPS6Q7L5N1 327 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NECTIN2Q92692 538 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANXA1P04083 346 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT24Q2M2I5 525 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC93Q567U6 631 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRAGCQ9HB90 399 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFT57Q9NWB7 429 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF853P0CG23 659 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNAI1P63096 354 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTKN2Q8IZC4 609 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MBIPQ9NS73 344 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NTSR2O95665 410 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.67■□□□□ 0.74
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP98P52948 1817 aa19.67■□□□□ 0.74
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