RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SERTAD1Q9UHV2 236 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 IGFBP4P22692 258 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PSME1Q06323 249 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NR5A1Q13285 461 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SOGA3Q5TF21 947 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM46Q7Z4K8 759 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP4P98171 946 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ECM1Q16610 540 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 C6orf118Q5T5N4 469 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TNS4Q8IZW8 715 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 MPNDQ8N594 471 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 HELQQ8TDG4 1101 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 WASLO00401 505 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PRMT3O60678 531 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZVU0 165 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PRIMPOLQ96LW4 560 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PARP3Q9Y6F1 533 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PRU2 124 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF15O94989 841 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 EPHA4P54764 986 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TGIF2Q9GZN2 237 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF358Q9NW07 568 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFB5O43674 189 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ABL1P00519 1130 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 BAG6P46379 1132 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 GDF10P55107 478 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PDE3BQ13370 1112 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 MTMR3Q13615 1198 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 MEIOBQ8N635 442 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CNKSR1Q969H4 720 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 MKNK1Q9BUB5 465 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TREHO43280 583 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 FAM26DQ5JW98 314 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ZFP42Q96MM3 310 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 BACH1O14867 736 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ADH1AP07327 375 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 TMC4Q7Z404 712 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 GMLQ99445 158 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 HRH3Q9Y5N1 445 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 INHAP05111 366 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 MEN1O00255 615 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PLCB3Q01970 1234 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 DSC3Q14574 896 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 TMX1Q9H3N1 280 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 SEPT3Q9UH03 358 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PROCP04070 461 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 NEFLP07196 543 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ATP2B2Q01814 1243 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 FBF1Q8TES7 1133 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 P4HBP07237 508 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 RHOQP17081 205 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PHKA2P46019 1235 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 DAB2P98082 770 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 HINFPQ9BQA5 517 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 BACH2Q9BYV9 841 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 SAP130Q9H0E3 1048 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 HCN2Q9UL51 889 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 BRPF3Q9ULD4 1205 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 BMP2P12643 396 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 USP5P45974 858 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms