RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 H0YIN7 160 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CHD4Q14839 1912 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF853P0CG23 659 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE6BP35913 854 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 CHRNA5P30532 468 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-210ENST00000505941 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 HLFQ16534 295 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT24Q2M2I5 525 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 WWC1Q8IX03 1113 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 BCORQ6W2J9 1755 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNA3P22001 575 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 PDIA6Q15084 440 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 NYXQ9GZU5 481 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM177BA6PVY3 158 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 ANXA1P04083 346 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 COPS6Q7L5N1 327 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
SH3BP2-210ENST00000505941 IL16Q14005 1332 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 PROSER3Q2NL68 480 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 TTLL6Q8N841 843 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 HYPKQ9NX55 129 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR63Q8IWG1 891 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 UTRNP46939 3433 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 GPTP24298 496 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 PARP10Q53GL7 1025 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP10DQ9P241 1426 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 NUP98P52948 1817 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 CNKSR1Q969H4 720 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 CCER2I3L3R5 266 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 MASTLQ96GX5 879 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 STYK1Q6J9G0 422 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 STK31Q9BXU1 1019 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 SRGNP10124 158 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA2Q08379 1002 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 TCIRG1Q13488 830 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 SUSD4Q5VX71 490 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 NPR1P16066 1061 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 ERFEQ4G0M1 354 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-210ENST00000505941 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.14■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPYL6Q8N831 410 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH1B1P30837 517 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 SOGA3Q5TF21 947 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 NTSR2O95665 410 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRP3Q96P20 1036 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 C21orf2O43822 256 aa27.09■■□□□ 1.93
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