RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 MAPK1P28482 360 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 POU4F2Q12837 409 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 C4orf17Q53FE4 359 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 MPSTP25325 297 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 DGKZQ13574 1117 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 STIM2Q9P246 746 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 RHOQP17081 205 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 KLK14Q9P0G3 267 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 TXLNAP40222 546 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 RTN1Q16799 776 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 TMC1Q8TDI8 760 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGAP4P98171 946 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 KRT76Q01546 638 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 RNF217Q8TC41 542 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 IFT43Q96FT9 208 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 MYO19Q96H55 970 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 SLC35F4A4IF30 521 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF10BO14763 440 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 NDUFB5O43674 189 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ABTB2Q8N961 1025 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB39O15060 712 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ECM1Q16610 540 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 NPR3P17342 541 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ERCC3P19447 782 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 POTEAQ6S8J7 498 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ATCAYQ86WG3 371 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF428Q96B54 188 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ITGA6P23229 1130 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 TREML1Q86YW5 311 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 GPAMQ9HCL2 828 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1B-215ENST00000498054 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1B0GTH6 734 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 CDC14CA4D256 554 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 MSX1P28360 303 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 ZAP70P43403 619 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 HIF1AQ16665 826 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 WDR44Q5JSH3 913 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 FAM26DQ5JW98 314 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 TTC16Q8NEE8 873 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 FZD6O60353 706 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 PCSK2P16519 638 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 GPR152Q8TDT2 470 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 EDEM1Q92611 657 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 SUSD3Q96L08 255 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 ASB16Q96NS5 453 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 MICAL2O94851 1124 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 PGBD3Q8N328 593 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 KLRG1Q96E93 195 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 RUBCNLQ9H714 662 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 POLIQ9UNA4 740 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PNR3 127 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 ATP4AP20648 1035 aa7.24□□□□□ -1.25
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