RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.75■■■□□ 2.35
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SENP6-211ENST00000493959 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.357e-14■□□□□ 10.5
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SENP6-211ENST00000493959 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
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SENP6-211ENST00000493959 NUP98P52948 1817 aa29.64■■■□□ 2.33
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SENP6-211ENST00000493959 MASTLQ96GX5 879 aa29.62■■■□□ 2.33
SENP6-211ENST00000493959 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.61■■■□□ 2.33
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SENP6-211ENST00000493959 SLX4Q8IY92 1834 aa29.61■■■□□ 2.33
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SENP6-211ENST00000493959 ABCC12Q96J65 1359 aa29.54■■■□□ 2.32
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SENP6-211ENST00000493959 IFT57Q9NWB7 429 aa29.49■■■□□ 2.31
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SENP6-211ENST00000493959 SYNE4Q8N205 404 aa29.46■■■□□ 2.31
SENP6-211ENST00000493959 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.46■■■□□ 2.31
SENP6-211ENST00000493959 TCIRG1Q13488 830 aa29.45■■■□□ 2.31
SENP6-211ENST00000493959 PARP10Q53GL7 1025 aa29.45■■■□□ 2.31
SENP6-211ENST00000493959 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.45■■■□□ 2.31
SENP6-211ENST00000493959 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SENP6-211ENST00000493959 TOMM70O94826 608 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 ALDH1B1P30837 517 aa29.44■■■□□ 2.3
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