RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDSP1-211ENST00000492545 CHL1O00533 1208 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDSP1-211ENST00000492545 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDSP1-211ENST00000492545 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDSP1-211ENST00000492545 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
CTDSP1-211ENST00000492545 BCORQ6W2J9 1755 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 C1QTNF8P60827 252 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 NGEFQ8N5V2 710 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 MYL6BP14649 208 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 HLFQ16534 295 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 STYK1Q6J9G0 422 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC24Q8N4L8 307 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CNKSR1Q969H4 720 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP44Q96MT7 982 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDSP1-211ENST00000492545 APAF1O14727 1248 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 SRGNP10124 158 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 MASTLQ96GX5 879 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 NYXQ9GZU5 481 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 HOXB7P09629 217 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 PDIA6Q15084 440 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 ANP32CO43423 234 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF181Q9P0P0 153 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CTDSP1-211ENST00000492545 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 LMNB1P20700 586 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 NPR1P16066 1061 aa30.81■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 SOGA3Q5TF21 947 aa30.81■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.81■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 IFT57Q9NWB7 429 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM177BA6PVY3 158 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF853P0CG23 659 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 GNAI1P63096 354 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 C21orf2O43822 256 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 PARP10Q53GL7 1025 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 PROSER3Q2NL68 480 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 MBIPQ9NS73 344 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.76■■■□□ 2.52
CTDSP1-211ENST00000492545 RASSF7Q02833 373 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT24Q2M2I5 525 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC184Q52MB2 194 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 COPS6Q7L5N1 327 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 NFKBIEO00221 500 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF3CO14782 793 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 GPTP24298 496 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 ALDH1B1P30837 517 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 NECTIN2Q92692 538 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 ANXA1P04083 346 aa30.74■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.74■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.74■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 MRS2Q9HD23 443 aa30.74■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP98P52948 1817 aa30.74■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 SUSD4Q5VX71 490 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC27Q2M243 656 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 CRY2Q49AN0 593 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 ERFEQ4G0M1 354 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 SBF1O95248 1867 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 HYPKQ9NX55 129 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDSP1-211ENST00000492545 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 NTSR2O95665 410 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 TOMM70O94826 608 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 PRELPP51888 382 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 TCIRG1Q13488 830 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC93Q567U6 631 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDSP1-211ENST00000492545 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
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