RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489356.1

FGD2-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene FGD2, Length 1,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2-208ENST00000489356 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.13■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 RNF181Q9P0P0 153 aa23.13■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 HLFQ16534 295 aa23.12■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.11■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.11■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.1■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 RASSF7Q02833 373 aa23.1■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.1■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.09■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.08■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 NECTIN2Q92692 538 aa23.08■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 BCORQ6W2J9 1755 aa23.08■■□□□ 1.29
FGD2-208ENST00000489356 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.08■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.08■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.08■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 C21orf2O43822 256 aa23.07■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.06■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.06■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.05■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 GPTP24298 496 aa23.05■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 CNKSR1Q969H4 720 aa23.05■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.04■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 RGL2O15211 777 aa23.04■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 ANXA1P04083 346 aa23.04■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 SRGNP10124 158 aa23.04■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 STYK1Q6J9G0 422 aa23.04■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 MASTLQ96GX5 879 aa23.04■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 ERBB4Q15303 1308 aa23.03■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 CHL1O00533 1208 aa23.03■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 KIF3CO14782 793 aa23.03■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 LMNB1P20700 586 aa23.03■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 KRT24Q2M2I5 525 aa23.03■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.03■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 APAF1O14727 1248 aa23.02■■□□□ 1.28
FGD2-208ENST00000489356 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.02■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 PROSER3Q2NL68 480 aa23.01■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.01■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 NFKBIEO00221 500 aa23■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 PDIA6Q15084 440 aa23■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 NYXQ9GZU5 481 aa23■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 NPR1P16066 1061 aa22.99■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 PRELPP51888 382 aa22.99■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 ERFEQ4G0M1 354 aa22.98■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 CCDC184Q52MB2 194 aa22.98■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 SUSD4Q5VX71 490 aa22.97■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 COPS6Q7L5N1 327 aa22.97■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.97■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 CFAP44Q96MT7 982 aa22.97■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 RRAGCQ9HB90 399 aa22.97■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.95■■□□□ 1.27
FGD2-208ENST00000489356 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 SOGA3Q5TF21 947 aa22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 SBF1O95248 1867 aa22.95■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 TOMM70O94826 608 aa22.94■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.94■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 MBIPQ9NS73 344 aa22.94■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.94■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 ANP32CO43423 234 aa22.93■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 ABCC12Q96J65 1359 aa22.93■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 NUP98P52948 1817 aa22.93■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 SLX4Q8IY92 1834 aa22.93■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 ALDH1B1P30837 517 aa22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 PARP10Q53GL7 1025 aa22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 CCDC93Q567U6 631 aa22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 HSPA6P17066 643 aa22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 OLFM4Q6UX06 510 aa22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 CACNA1SQ13698 1873 aa22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 GLTPD2A6NH11 291 aa22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 NTSR2O95665 410 aa22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 GNAI1P63096 354 aa22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.9■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.9■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.9■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 MRS2Q9HD23 443 aa22.9■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 IFT57Q9NWB7 429 aa22.9■■□□□ 1.26
FGD2-208ENST00000489356 HOXB7P09629 217 aa22.89■■□□□ 1.25
FGD2-208ENST00000489356 ZNF428Q96B54 188 aa22.89■■□□□ 1.25
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