RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484063.6

PRDM2-207, Transcript of PR/SET domain 2, humanhuman

TSL 5

Gene PRDM2, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2-207ENST00000484063 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 MYL6BP14649 208 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 ST5P78524 1137 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 CFAP44Q96MT7 982 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 MRS2Q9HD23 443 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
PRDM2-207ENST00000484063 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 HLFQ16534 295 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 TTLL6Q8N841 843 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 NUP98P52948 1817 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 HOXB7P09629 217 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 GNAI1P63096 354 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 IFT57Q9NWB7 429 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 ADCY9O60503 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 ZNF853P0CG23 659 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 PDIA6Q15084 440 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 MBIPQ9NS73 344 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 ATP10DQ9P241 1426 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM2-207ENST00000484063 KRT24Q2M2I5 525 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 NYXQ9GZU5 481 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 NECTIN2Q92692 538 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 FAM177BA6PVY3 158 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 CCDC27Q2M243 656 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 PROSER3Q2NL68 480 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 STYK1Q6J9G0 422 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 CNKSR1Q969H4 720 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 ANXA1P04083 346 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 SRGNP10124 158 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 MASTLQ96GX5 879 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 COPS6Q7L5N1 327 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PRDM2-207ENST00000484063 GPTP24298 496 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 PARP10Q53GL7 1025 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 NPR1P16066 1061 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 SBF1O95248 1867 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 SUSD4Q5VX71 490 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 WWC1Q8IX03 1113 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 HYPKQ9NX55 129 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 RNF181Q9P0P0 153 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 C21orf2O43822 256 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 ERFEQ4G0M1 354 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 SOGA3Q5TF21 947 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM2-207ENST00000484063 IL16Q14005 1332 aa26.32■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 SLX4Q8IY92 1834 aa26.32■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 CACNA1SQ13698 1873 aa26.32■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 NTSR2O95665 410 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 LMNB1P20700 586 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 ALDH1B1P30837 517 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 RASSF7Q02833 373 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 TCIRG1Q13488 830 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.3■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.3■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.3■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.3■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 ABCC12Q96J65 1359 aa26.3■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 C1QTNF8P60827 252 aa26.29■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.29■■□□□ 1.8
PRDM2-207ENST00000484063 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms