RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C4-202ENST00000483873 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.34■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 DCAF8L1A6NGE4 600 aa34.33■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF521Q96K83 1311 aa34.33■■■■□ 3.09
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GTF3C4-202ENST00000483873 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.29■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 XAGE3Q8WTP9 111 aa34.28■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SETDB2Q96T68 719 aa34.28■■■■□ 3.08
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GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.25■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 WWC3Q9ULE0 1092 aa34.24■■■■□ 3.07
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GTF3C4-202ENST00000483873 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.2■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 DPEP1P16444 411 aa34.2■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
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GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.19■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM177BA6PVY3 158 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
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GTF3C4-202ENST00000483873 CNBD1Q8NA66 436 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.18■■■■□ 3.06
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GTF3C4-202ENST00000483873 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.12■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.12■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 CACNA1FO60840 1977 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 ST5P78524 1137 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 E9PSI1 815 aa34.1■■■■□ 3.05
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GTF3C4-202ENST00000483873 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 STK31Q9BXU1 1019 aa34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 SUSD4Q5VX71 490 aa34.09■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.09■■■■□ 3.05
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GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF428Q96B54 188 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 H0YIN7 160 aa34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 NLRP10Q86W26 655 aa34.03■■■■□ 3.04
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GTF3C4-202ENST00000483873 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.01■■■■□ 3.03
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