RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 MYL6BP14649 208 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 ST5P78524 1137 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 RASSF7Q02833 373 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 RNF181Q9P0P0 153 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 FAM177BA6PVY3 158 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.64■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 RGL2O15211 777 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 KIF3CO14782 793 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 C21orf2O43822 256 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 SRGNP10124 158 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 PRELPP51888 382 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 CHL1O00533 1208 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 PDIA6Q15084 440 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 ERBB4Q15303 1308 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 NFKBIEO00221 500 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 ANXA1P04083 346 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 KRT24Q2M2I5 525 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 STYK1Q6J9G0 422 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 NECTIN2Q92692 538 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 MASTLQ96GX5 879 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-211ENST00000482015 PROSER3Q2NL68 480 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 CNKSR1Q969H4 720 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 LMNB1P20700 586 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 GPTP24298 496 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 APAF1O14727 1248 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 CCDC184Q52MB2 194 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 SBF1O95248 1867 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 NPR1P16066 1061 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 ERFEQ4G0M1 354 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 NYXQ9GZU5 481 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-211ENST00000482015 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 SUSD4Q5VX71 490 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 CFAP44Q96MT7 982 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 ABCC12Q96J65 1359 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 COPS6Q7L5N1 327 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 SLX4Q8IY92 1834 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 RRAGCQ9HB90 399 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 MBIPQ9NS73 344 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 NUP98P52948 1817 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 TOMM70O94826 608 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 SOGA3Q5TF21 947 aa24.47■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.47■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 NTSR2O95665 410 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 ZNF853P0CG23 659 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 HSPA6P17066 643 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 OLFM4Q6UX06 510 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-211ENST00000482015 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 GLTPD2A6NH11 291 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 CRY2Q49AN0 593 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 HOXB7P09629 217 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 ALDH1B1P30837 517 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 PARP10Q53GL7 1025 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 CCDC93Q567U6 631 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 IFT57Q9NWB7 429 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 CACNA1SQ13698 1873 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 GNAI1P63096 354 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms