RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478021.1

TRAF4-211, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 718 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF853P0CG23 659 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.62■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 NUP98P52948 1817 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 PDIA6Q15084 440 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 PROSER3Q2NL68 480 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 IFT57Q9NWB7 429 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 GNAI1P63096 354 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.6■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 NPHP1O15259 732 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 PIM2Q9P1W9 311 aa29.58■■■□□ 2.33
TRAF4-211ENST00000478021 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 CNBD1Q8NA66 436 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 FAM177BA6PVY3 158 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 WWC1Q8IX03 1113 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 RGL2O15211 777 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 CCDC27Q2M243 656 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 HOXB7P09629 217 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 ST5P78524 1137 aa29.53■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
TRAF4-211ENST00000478021 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 H0YIN7 160 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 GPTP24298 496 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 PDE6BP35913 854 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 COPS6Q7L5N1 327 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 ATP10DQ9P241 1426 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.49■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 CACNA1SQ13698 1873 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 TTLL6Q8N841 843 aa29.45■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TRAF4-211ENST00000478021 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.44■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.44■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 TSPYL6Q8N831 410 aa29.44■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 SUSD4Q5VX71 490 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 IL16Q14005 1332 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 ABCC12Q96J65 1359 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 NYXQ9GZU5 481 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 SRGNP10124 158 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 ERFEQ4G0M1 354 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 HYPKQ9NX55 129 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 WDR63Q8IWG1 891 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
TRAF4-211ENST00000478021 NTSR2O95665 410 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 SLX4Q8IY92 1834 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 ADCY9O60503 1353 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 PARP10Q53GL7 1025 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 STYK1Q6J9G0 422 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 MASTLQ96GX5 879 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 RASSF7Q02833 373 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 TCIRG1Q13488 830 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF428Q96B54 188 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 SBF1O95248 1867 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 CNKSR1Q969H4 720 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 CCER2I3L3R5 266 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 C21orf2O43822 256 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAF4-211ENST00000478021 NPR1P16066 1061 aa29.33■■■□□ 2.29
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