RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPR162Q16538 588 aa32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF3-208ENST00000477440 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF652Q9Y2D9 606 aa32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF3-208ENST00000477440 HLFQ16534 295 aa32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLEC4GQ6UXB4 293 aa32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 IL16Q14005 1332 aa32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 WWC3Q9ULE0 1092 aa32.93■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.93■■■□□ 2.86
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TGFB2P61812 414 aa32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 SETDB2Q96T68 719 aa32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGL2O15211 777 aa32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 C8orf58Q8NAV2 365 aa32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 A0A0G2JLW4 131 aa32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 DPEP1P16444 411 aa32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHD4Q14839 1912 aa32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 WDR63Q8IWG1 891 aa32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF3-208ENST00000477440 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 MIER1Q8N108 512 aa32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 TSPYL6Q8N831 410 aa32.86■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP10DQ9P241 1426 aa32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 COPS6Q7L5N1 327 aa32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNA3P22001 575 aa32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHRNA5P30532 468 aa32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 CNBD1Q8NA66 436 aa32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF521Q96K83 1311 aa32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
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ARHGEF3-208ENST00000477440 NPHP1O15259 732 aa32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM177BA6PVY3 158 aa32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPTP24298 496 aa32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 GRIN3BO60391 1043 aa32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 HYPKQ9NX55 129 aa32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCS1LQ9Y276 419 aa32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 ST5P78524 1137 aa32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIM2Q9P1W9 311 aa32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC30Q5VVM6 783 aa32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
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ARHGEF3-208ENST00000477440 GOLGA2Q08379 1002 aa32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDE6BP35913 854 aa32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.72■■■□□ 2.83
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ARHGEF3-208ENST00000477440 H0YIN7 160 aa32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 SUSD4Q5VX71 490 aa32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLBD2Q8NHP8 589 aa32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCC12Q96J65 1359 aa32.7■■■□□ 2.83
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ARHGEF3-208ENST00000477440 YY1P25490 414 aa32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 NYXQ9GZU5 481 aa32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 NTSR2O95665 410 aa32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 TCIRG1Q13488 830 aa32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 PARP10Q53GL7 1025 aa32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERFEQ4G0M1 354 aa32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 STK31Q9BXU1 1019 aa32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 VAMP4O75379 141 aa32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 NLRP10Q86W26 655 aa32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLX4Q8IY92 1834 aa32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 SRGNP10124 158 aa32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 TTLL6Q8N841 843 aa32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
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