RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa17.31■□□□□ 0.36
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PRAME-211ENST00000476336 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 WWC1Q8IX03 1113 aa17.31■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.31■□□□□ 0.36
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PRAME-211ENST00000476336 NPHP1O15259 732 aa17.3■□□□□ 0.36
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PRAME-211ENST00000476336 WDR63Q8IWG1 891 aa17.29■□□□□ 0.36
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PRAME-211ENST00000476336 HYPKQ9NX55 129 aa17.27■□□□□ 0.36
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PRAME-211ENST00000476336 H0YIN7 160 aa17.26■□□□□ 0.35
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PRAME-211ENST00000476336 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
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PRAME-211ENST00000476336 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-211ENST00000476336 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.21■□□□□ 0.35
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PRAME-211ENST00000476336 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-211ENST00000476336 KIF3CO14782 793 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 CHRNA5P30532 468 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA2Q08379 1002 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 PROSER3Q2NL68 480 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 HSPA6P17066 643 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 STYK1Q6J9G0 422 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 CNKSR1Q969H4 720 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 MASTLQ96GX5 879 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 STK31Q9BXU1 1019 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
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PRAME-211ENST00000476336 ANXA1P04083 346 aa17.18■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 TCIRG1Q13488 830 aa17.18■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 SRGNP10124 158 aa17.17■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 NPR1P16066 1061 aa17.17■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 SOGA3Q5TF21 947 aa17.17■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 GPTP24298 496 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 ALDH1B1P30837 517 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 UBN2Q6ZU65 1347 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 SBF1O95248 1867 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-211ENST00000476336 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
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