RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0G2JLW4	131 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	HLF	Q16534	295 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFT57	Q9NWB7	429 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	UTRN	P46939	3433 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP10D	Q9P241	1426 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERBB4	Q15303	1308 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNA3	P22001	575 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRNA5	P30532	468 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	WWC1	Q8IX03	1113 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC27	Q2M243	656 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGFB2	P61812	414 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAI1	P63096	354 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCC12	Q96J65	1359 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLX4	Q8IY92	1834 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	SBF1	O95248	1867 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	YY1	P25490	414 aa		14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPYL6	Q8N831	410 aa		14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	14.47	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM177B	A6PVY3	158 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXB7	P09629	217 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNBD1	Q8NA66	436 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	SETDB2	Q96T68	719 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCS1L	Q9Y276	419 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		14.46	□□□□□ -0.09
GTPBP1-208	ENST00000475959	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		14.46	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		14.45	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPT	P24298	496 aa		14.45	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	14.45	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		14.44	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGL2	O15211	777 aa		14.44	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	14.44	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	COPS6	Q7L5N1	327 aa		14.44	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	14.44	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADCY9	O60503	1353 aa		14.44	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL16	Q14005	1332 aa		14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF521	Q96K83	1311 aa		14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF1	P21675	1872 aa		14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	14.43	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL4A1	P02462	1669 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNA1F	O60840	1977 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRIN3B	O60391	1043 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTSR2	O95665	410 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF428	Q96B54	188 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIM2	Q9P1W9	311 aa		14.42	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		14.41	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	14.41	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST5	P78524	1137 aa		14.41	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUSD4	Q5VX71	490 aa		14.41	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		14.41	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	14.41	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCER2	I3L3R5	266 aa		14.4	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPHP1	O15259	732 aa		14.4	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERFE	Q4G0M1	354 aa		14.4	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	14.4	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.4	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	14.4	□□□□□ -0.1
GTPBP1-208	ENST00000475959	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		14.39	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR63	Q8IWG1	891 aa		14.39	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIER1	Q8N108	512 aa		14.39	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959		H0YIN7	160 aa		14.38	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE6B	P35913	854 aa		14.38	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASSF7	Q02833	373 aa		14.38	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	14.38	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRGN	P10124	158 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRELP	P51888	382 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	NLRP10	Q86W26	655 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	14.37	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	HYPK	Q9NX55	129 aa		14.37	□□□□□ -0.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11

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