RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-204ENST00000475241 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 A0A0G2JLW4 131 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 DPEP1P16444 411 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 HLFQ16534 295 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 ATP10DQ9P241 1426 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 PROSER3Q2NL68 480 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 CNBD1Q8NA66 436 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 HYPKQ9NX55 129 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 KCNA3P22001 575 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 COPS6Q7L5N1 327 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 NECTIN2Q92692 538 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 PIM2Q9P1W9 311 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 PDE6BP35913 854 aa21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 NUP98P52948 1817 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 ANXA1P04083 346 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 ST5P78524 1137 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 NPHP1O15259 732 aa21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 NYXQ9GZU5 481 aa21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF521Q96K83 1311 aa21.79■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 H0YIN7 160 aa21.78■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.78■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.78■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 GOLGA2Q08379 1002 aa21.77■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 PARP10Q53GL7 1025 aa21.77■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 TSPYL6Q8N831 410 aa21.77■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.77■■□□□ 1.08
PKDCC-204ENST00000475241 CHD4Q14839 1912 aa21.76■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 CHRNA5P30532 468 aa21.76■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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PKDCC-204ENST00000475241 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.76■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 BCS1LQ9Y276 419 aa21.76■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 UTRNP46939 3433 aa21.76■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 YY1P25490 414 aa21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 TCIRG1Q13488 830 aa21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 MIER1Q8N108 512 aa21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.73■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 TTLL6Q8N841 843 aa21.73■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 STK31Q9BXU1 1019 aa21.73■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.73■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.73■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 GPTP24298 496 aa21.72■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.72■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.71■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 SRGNP10124 158 aa21.71■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 SUSD4Q5VX71 490 aa21.71■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 STYK1Q6J9G0 422 aa21.71■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.71■■□□□ 1.07
PKDCC-204ENST00000475241 VAMP4O75379 141 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 NTSR2O95665 410 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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PKDCC-204ENST00000475241 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 MASTLQ96GX5 879 aa21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 FAM177BA6PVY3 158 aa21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 E9PSI1 815 aa21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 NLRP10Q86W26 655 aa21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 CNKSR1Q969H4 720 aa21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 NPR1P16066 1061 aa21.68■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.68■■□□□ 1.06
PKDCC-204ENST00000475241 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.68■■□□□ 1.06
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