RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 CCDC24Q8N4L8 307 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 CNBD1Q8NA66 436 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 CFAP44Q96MT7 982 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 HLFQ16534 295 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 KRT24Q2M2I5 525 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 KIF6Q6ZMV9 814 aa40.57■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 TTLL7Q6ZT98 887 aa40.57■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 C2CD5Q86YS7 1000 aa40.56■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 NUP98P52948 1817 aa40.56■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa40.55■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
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CHKB-205ENST00000468532 NECTIN2Q92692 538 aa40.54■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 BRIP1Q9BX63 1249 aa40.54■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 ERVV-1B6SEH8 477 aa40.53■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 H0YIN7 160 aa40.53■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 ST5P78524 1137 aa40.53■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 PDIA6Q15084 440 aa40.53■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa40.53■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 MBIPQ9NS73 344 aa40.52■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 PDE6BP35913 854 aa40.51■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 ZBTB3Q9H5J0 574 aa40.51■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 IFT57Q9NWB7 429 aa40.51■■■■■ 4.08
CHKB-205ENST00000468532 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 ANXA1P04083 346 aa40.5■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 ZNF853P0CG23 659 aa40.5■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 PROSER3Q2NL68 480 aa40.5■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa40.49■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 LRP10Q7Z4F1 713 aa40.49■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 GNAI1P63096 354 aa40.48■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 FAM177BA6PVY3 158 aa40.47■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa40.47■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 TTLL6Q8N841 843 aa40.46■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 ATP10DQ9P241 1426 aa40.46■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 ADCY9O60503 1353 aa40.46■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 HOXB7P09629 217 aa40.45■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 TPTE2Q6XPS3 522 aa40.45■■■■■ 4.07
CHKB-205ENST00000468532 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa40.44■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 DUSP27Q5VZP5 1158 aa40.42■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 CHPF2Q9P2E5 772 aa40.41■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 GPTP24298 496 aa40.4■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 CCDC27Q2M243 656 aa40.4■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 COPS6Q7L5N1 327 aa40.39■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 XAGE3Q8WTP9 111 aa40.39■■■■■ 4.06
CHKB-205ENST00000468532 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 UBN2Q6ZU65 1347 aa40.37■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 CACNA1SQ13698 1873 aa40.36■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 SRGNP10124 158 aa40.36■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 WWC1Q8IX03 1113 aa40.36■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 NYXQ9GZU5 481 aa40.36■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 ZNF34Q8IZ26 560 aa40.35■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 STYK1Q6J9G0 422 aa40.34■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 FAM9BQ8IZU0 186 aa40.34■■■■■ 4.05
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CHKB-205ENST00000468532 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 MASTLQ96GX5 879 aa40.33■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 NUTM1Q86Y26 1132 aa40.32■■■■■ 4.05
CHKB-205ENST00000468532 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa40.32■■■■■ 4.04
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CHKB-205ENST00000468532 SUSD4Q5VX71 490 aa40.31■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 C9orf131Q5VYM1 1079 aa40.31■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 CNKSR1Q969H4 720 aa40.31■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 ABCC12Q96J65 1359 aa40.31■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 SBF1O95248 1867 aa40.3■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa40.3■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 RASSF7Q02833 373 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 ERFEQ4G0M1 354 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 PARP10Q53GL7 1025 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 SLX4Q8IY92 1834 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 C8orf58Q8NAV2 365 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 NPR1P16066 1061 aa40.27■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa40.27■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 HYPKQ9NX55 129 aa40.27■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 C21orf2O43822 256 aa40.26■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 NTSR2O95665 410 aa40.26■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa40.26■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 RNF181Q9P0P0 153 aa40.26■■■■■ 4.04
CHKB-205ENST00000468532 IL16Q14005 1332 aa40.24■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 PLBD2Q8NHP8 589 aa40.22■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 RIC1Q4ADV7 1423 aa40.22■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 NFKBIEO00221 500 aa40.21■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 TCIRG1Q13488 830 aa40.21■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 TSPYL6Q8N831 410 aa40.21■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa40.2■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa40.2■■■■■ 4.03
CHKB-205ENST00000468532 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
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