RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 NEUROD2Q15784 382 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 NGEFQ8N5V2 710 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.22■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 MYL6BP14649 208 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 HLFQ16534 295 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 STYK1Q6J9G0 422 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 CNKSR1Q969H4 720 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 RNF181Q9P0P0 153 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.21■□□□□ 0.83
NISCH-205ENST00000467594 CHL1O00533 1208 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 SRGNP10124 158 aa20.2■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 MASTLQ96GX5 879 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 NYXQ9GZU5 481 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 LMNB1P20700 586 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 KIF3CO14782 793 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 SOGA3Q5TF21 947 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 FAM177BA6PVY3 158 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 C21orf2O43822 256 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 NPR1P16066 1061 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 RASSF7Q02833 373 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 PDIA6Q15084 440 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 CFAP44Q96MT7 982 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 SBF1O95248 1867 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-205ENST00000467594 APAF1O14727 1248 aa20.14■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.14■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 NFKBIEO00221 500 aa20.13■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 HOXB7P09629 217 aa20.13■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 NUP98P52948 1817 aa20.13■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.12■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 PARP10Q53GL7 1025 aa20.12■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.12■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 TOMM70O94826 608 aa20.11■□□□□ 0.81
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NISCH-205ENST00000467594 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ALDH1B1P30837 517 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 KRT24Q2M2I5 525 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 PROSER3Q2NL68 480 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 NECTIN2Q92692 538 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ANP32CO43423 234 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ANXA1P04083 346 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ZNF853P0CG23 659 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 PRELPP51888 382 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 GNAI1P63096 354 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 ERFEQ4G0M1 354 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 SUSD4Q5VX71 490 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 COPS6Q7L5N1 327 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 IFT57Q9NWB7 429 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 SLX4Q8IY92 1834 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 CRY2Q49AN0 593 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 CCDC93Q567U6 631 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 MBIPQ9NS73 344 aa20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NISCH-205ENST00000467594 GLTPD2A6NH11 291 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 NTSR2O95665 410 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 HSPA6P17066 643 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 ABCC12Q96J65 1359 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CCDC184Q52MB2 194 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.06■□□□□ 0.8
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