RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 SRGNP10124 158 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 ST5P78524 1137 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 LMNB1P20700 586 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 PDIA6Q15084 440 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 STYK1Q6J9G0 422 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 ERBB4Q15303 1308 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 C21orf2O43822 256 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ABCC12Q96J65 1359 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 HSPA6P17066 643 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 RUNDC1Q96C34 613 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 MASTLQ96GX5 879 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 CHL1O00533 1208 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 TOMM70O94826 608 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 MYL6BP14649 208 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 NGEFQ8N5V2 710 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 SBF1O95248 1867 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 PROSER3Q2NL68 480 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 CNKSR1Q969H4 720 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 SNED1Q8TER0 1413 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 FAM177BA6PVY3 158 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 NPHP1O15259 732 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 NPR1P16066 1061 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 NEUROD2Q15784 382 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 KRT24Q2M2I5 525 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 CRY2Q49AN0 593 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRF-211ENST00000467464 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.71■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 SLX4Q8IY92 1834 aa15.71■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 GLTPD2A6NH11 291 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 NTSR2O95665 410 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 ANXA1P04083 346 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 SUSD4Q5VX71 490 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 RRAGCQ9HB90 399 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 POTECB2RU33 542 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 GPTP24298 496 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 ERFEQ4G0M1 354 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 OLFM4Q6UX06 510 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 NYXQ9GZU5 481 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC93Q567U6 631 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 SOGA3Q5TF21 947 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 SLC51AQ86UW1 340 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 NECTIN2Q92692 538 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF853P0CG23 659 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC184Q52MB2 194 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 CFAP44Q96MT7 982 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 WDR90Q96KV7 1748 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 HOXB7P09629 217 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 FSTL1Q12841 308 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 PARP10Q53GL7 1025 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 COPS6Q7L5N1 327 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 NUP98P52948 1817 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRF-211ENST00000467464 APAF1O14727 1248 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 APLP1P51693 650 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 MBIPQ9NS73 344 aa15.64■□□□□ 0.09
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