RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HPS1-206ENST00000462743 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HPS1-206ENST00000462743 NUP98P52948 1817 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-206ENST00000462743 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 HLFQ16534 295 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 PROSER3Q2NL68 480 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 HYPKQ9NX55 129 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 COPS6Q7L5N1 327 aa15.63■□□□□ 0.09
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HPS1-206ENST00000462743 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 ANXA1P04083 346 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 GOLGA2Q08379 1002 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.62■□□□□ 0.09
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HPS1-206ENST00000462743 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 KCNA3P22001 575 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 NECTIN2Q92692 538 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 ATP10DQ9P241 1426 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.6■□□□□ 0.09
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HPS1-206ENST00000462743 DPEP1P16444 411 aa15.6■□□□□ 0.09
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HPS1-206ENST00000462743 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 A0A0G2JLW4 131 aa15.59■□□□□ 0.09
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HPS1-206ENST00000462743 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-206ENST00000462743 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 TCIRG1Q13488 830 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 PARP10Q53GL7 1025 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 CNBD1Q8NA66 436 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
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HPS1-206ENST00000462743 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
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HPS1-206ENST00000462743 PIM2Q9P1W9 311 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 CHD4Q14839 1912 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.56■□□□□ 0.08
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HPS1-206ENST00000462743 H0YIN7 160 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 ST5P78524 1137 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 SUSD4Q5VX71 490 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.55■□□□□ 0.08
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HPS1-206ENST00000462743 STK31Q9BXU1 1019 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 GPTP24298 496 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 CHRNA5P30532 468 aa15.54■□□□□ 0.08
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HPS1-206ENST00000462743 SLC4A2P04920 1241 aa15.53■□□□□ 0.08
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HPS1-206ENST00000462743 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 SRGNP10124 158 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 STYK1Q6J9G0 422 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 TTLL6Q8N841 843 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HPS1-206ENST00000462743 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 NPHP1O15259 732 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 KSR2Q6VAB6 950 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZNF428Q96B54 188 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 BCS1LQ9Y276 419 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-206ENST00000462743 NPR1P16066 1061 aa15.5■□□□□ 0.07
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