RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CITED1-208	ENST00000450875	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	ANXA1	P04083	346 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	SERPINB2	P05120	415 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TM4SF1	P30408	202 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	DDR1	Q08345	913 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	GPR162	Q16538	588 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TGFB2	P61812	414 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	ST5	P78524	1137 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	PDIA6	Q15084	440 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	HLF	Q16534	295 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	SCN7A	Q01118	1682 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875		E9PSI1	815 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	RGL2	O15211	777 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	GPT	P24298	496 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0G2JLW4	131 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	PDE6B	P35913	854 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CITED1-208	ENST00000450875	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.4	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF521	Q96K83	1311 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875		H0YIN7	160 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	DPEP1	P16444	411 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	VAMP4	O75379	141 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	CHRNA5	P30532	468 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PIM2	Q9P1W9	311 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	BCS1L	Q9Y276	419 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.37	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	ATP10D	Q9P241	1426 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	NUP98	P52948	1817 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	SUSD4	Q5VX71	490 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	MYD88	Q99836	296 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	10.35	□□□□□ -0.75
CITED1-208	ENST00000450875	FLII	Q13045	1269 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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