RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449684.6

LIMS1-210, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIMS1, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 ATP10DQ9P241 1426 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 BCORQ6W2J9 1755 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 FAM177BA6PVY3 158 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 APAF1O14727 1248 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 RGL2O15211 777 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 ERBB4Q15303 1308 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 CHL1O00533 1208 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 HLFQ16534 295 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 NECTIN2Q92692 538 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-210ENST00000449684 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 MRS2Q9HD23 443 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 ADCY9O60503 1353 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 CFAP44Q96MT7 982 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 NYXQ9GZU5 481 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 CNKSR1Q969H4 720 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 RNF181Q9P0P0 153 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 C1QTNF8P60827 252 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 CCDC184Q52MB2 194 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 MASTLQ96GX5 879 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 ANXA1P04083 346 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 GPTP24298 496 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 GNAI1P63096 354 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 KRT24Q2M2I5 525 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 STYK1Q6J9G0 422 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 C21orf2O43822 256 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 SRGNP10124 158 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-210ENST00000449684 NPR1P16066 1061 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 RASSF7Q02833 373 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 PDIA6Q15084 440 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 PROSER3Q2NL68 480 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 COPS6Q7L5N1 327 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 MBIPQ9NS73 344 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 IFT57Q9NWB7 429 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 HOXB7P09629 217 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 NUP98P52948 1817 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 LMNB1P20700 586 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 PARP10Q53GL7 1025 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 SOGA3Q5TF21 947 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF853P0CG23 659 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 ALDH1B1P30837 517 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 ERFEQ4G0M1 354 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 SUSD4Q5VX71 490 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.09■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.09■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 HYPKQ9NX55 129 aa20.08■□□□□ 0.81
LIMS1-210ENST00000449684 NFKBIEO00221 500 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 CACNA1SQ13698 1873 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 CCDC93Q567U6 631 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 NLRP3Q96P20 1036 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 ABCC12Q96J65 1359 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 SBF1O95248 1867 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 SLX4Q8IY92 1834 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 NTSR2O95665 410 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 TCIRG1Q13488 830 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 CCDC27Q2M243 656 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-210ENST00000449684 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.05■□□□□ 0.8
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