RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.99■□□□□ 0.63
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.99■□□□□ 0.63
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNBD1Q8NA66 436 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.98■□□□□ 0.63
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTLL6Q8N841 843 aa18.95■□□□□ 0.62
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NECTIN2Q92692 538 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RGL2O15211 777 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE6BP35913 854 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ST5P78524 1137 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCC12Q96J65 1359 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERBB4Q15303 1308 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPHP1O15259 732 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LAMB2P55268 1798 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.92■□□□□ 0.62
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF181Q9P0P0 153 aa18.92■□□□□ 0.62
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.89■□□□□ 0.61
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.87■□□□□ 0.61
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NTSR2O95665 410 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNKSR1Q969H4 720 aa18.85■□□□□ 0.61
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OLFM4Q6UX06 510 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COPS6Q7L5N1 327 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC51AQ86UW1 340 aa18.85■□□□□ 0.61
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPR1P16066 1061 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LMNB1P20700 586 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFT57Q9NWB7 429 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NYXQ9GZU5 481 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRS2Q9HD23 443 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HOXB7P09629 217 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRY2Q49AN0 593 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNED1Q8TER0 1413 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANP32CO43423 234 aa18.81■□□□□ 0.6
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
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