RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNQ4P56696 695 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MSL1Q68DK7 614 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABTB2Q8N961 1025 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NLRP7Q8WX94 980 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NBPF3Q9H094 633 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.09□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PACS2Q86VP3 889 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.08□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACEP12821 1306 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5P01031 1676 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRSS12P56730 875 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APBB1O00213 710 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOMM70O94826 608 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LTN1O94822 1766 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL9A1P20849 921 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR7Q9Y216 660 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.03□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MCM6Q14566 821 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.03□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.03□□□□□ -1.12
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NLRP13Q86W25 1043 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.02□□□□□ -1.13
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.01□□□□□ -1.13
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK19Q9BWU1 502 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC7Q96M83 1385 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAK2O60296 914 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DIXDC1Q155Q3 683 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAF7LQ5H9L4 462 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EYA1Q99502 592 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SBF1O95248 1867 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGPD2P0DJD1 1756 aa8□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RCCD1A6NED2 376 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC4A3P48751 1232 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PROX2Q3B8N5 592 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C4BP0C0L5 1744 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HRO43593 1189 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE4CQ08493 712 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM5Q71RC9 77 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSKSQ9UJT2 592 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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