RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.82■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF652Q9Y2D9 606 aa36.81■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 NFKBIEO00221 500 aa36.8■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.8■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 SRGNP10124 158 aa36.78■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 ST5P78524 1137 aa36.78■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 NGEFQ8N5V2 710 aa36.77■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.77■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.76■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TRIOBP-209ENST00000428075 NPHP1O15259 732 aa36.75■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 C21orf2O43822 256 aa36.74■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 LMNB1P20700 586 aa36.74■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 STYK1Q6J9G0 422 aa36.74■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 SLX4Q8IY92 1834 aa36.73■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.73■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 MYL6BP14649 208 aa36.72■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPA6P17066 643 aa36.72■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa36.71■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 ERVV-1B6SEH8 477 aa36.71■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 LRP10Q7Z4F1 713 aa36.71■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 MASTLQ96GX5 879 aa36.71■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 BABAM1Q9NWV8 329 aa36.71■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.71■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM177BA6PVY3 158 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 TOMM70O94826 608 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 NEUROD2Q15784 382 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 TPTE2Q6XPS3 522 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 CNKSR1Q969H4 720 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 RUNDC1Q96C34 613 aa36.7■■■■□ 3.47
TRIOBP-209ENST00000428075 PDIA6Q15084 440 aa36.69■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa36.69■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa36.69■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP98P52948 1817 aa36.69■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 ERBB4Q15303 1308 aa36.67■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 KDM2BQ8NHM5 1336 aa36.67■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 C7orf43Q8WVR3 580 aa36.66■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa36.66■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 PROSER3Q2NL68 480 aa36.65■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBTB3Q9H5J0 574 aa36.65■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 CACNA1SQ13698 1873 aa36.65■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 CHL1O00533 1208 aa36.64■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF6Q6ZMV9 814 aa36.64■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 RRAGCQ9HB90 399 aa36.64■■■■□ 3.46
TRIOBP-209ENST00000428075 UBN2Q6ZU65 1347 aa36.63■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC12Q96J65 1359 aa36.63■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 NPR1P16066 1061 aa36.62■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 KRT24Q2M2I5 525 aa36.62■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 TIAM2Q8IVF5 1701 aa36.62■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 LTBP3Q9NS15 1303 aa36.61■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 ANXA1P04083 346 aa36.61■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 GLTPD2A6NH11 291 aa36.6■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 GPTP24298 496 aa36.6■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 NUTM1Q86Y26 1132 aa36.6■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF34Q8IZ26 560 aa36.6■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 ERFEQ4G0M1 354 aa36.58■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 SUSD4Q5VX71 490 aa36.58■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
TRIOBP-209ENST00000428075 TAOK3Q9H2K8 898 aa36.57■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 OLFM4Q6UX06 510 aa36.56■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 NECTIN2Q92692 538 aa36.56■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 NYXQ9GZU5 481 aa36.56■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CRY2Q49AN0 593 aa36.55■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SOGA3Q5TF21 947 aa36.54■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 POTECB2RU33 542 aa36.52■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 NTSR2O95665 410 aa36.52■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC93Q567U6 631 aa36.5■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 RIC1Q4ADV7 1423 aa36.5■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 COPS6Q7L5N1 327 aa36.49■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 APAF1O14727 1248 aa36.48■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 C3orf67Q6ZVT6 689 aa36.48■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 XAGE3Q8WTP9 111 aa36.48■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 APLP1P51693 650 aa36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 FSTL1Q12841 308 aa36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC184Q52MB2 194 aa36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP44Q96MT7 982 aa36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 SNED1Q8TER0 1413 aa36.47■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 ALDH1B1P30837 517 aa36.46■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR90Q96KV7 1748 aa36.45■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF853P0CG23 659 aa36.45■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms