RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa32.45■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.45■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.45■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CHRNA5P30532 468 aa32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.44■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NPHP1O15259 732 aa32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXB7P09629 217 aa32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 C8orf58Q8NAV2 365 aa32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.43■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.42■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIN3BO60391 1043 aa32.42■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM177BA6PVY3 158 aa32.41■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNA3P22001 575 aa32.41■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.41■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 YY1P25490 414 aa32.4■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 COPS6Q7L5N1 327 aa32.4■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 BCS1LQ9Y276 419 aa32.4■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 RGL2O15211 777 aa32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CNBD1Q8NA66 436 aa32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.39■■■□□ 2.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP98P52948 1817 aa32.38■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 IL16Q14005 1332 aa32.38■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CCER2I3L3R5 266 aa32.38■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR63Q8IWG1 891 aa32.37■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PIM2Q9P1W9 311 aa32.37■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 GPTP24298 496 aa32.36■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.36■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPYL6Q8N831 410 aa32.36■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ST5P78524 1137 aa32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 UTRNP46939 3433 aa32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CHD4Q14839 1912 aa32.34■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
HTATSF1-202ENST00000425695 H0YIN7 160 aa32.32■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE6BP35913 854 aa32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 MIER1Q8N108 512 aa32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 HYPKQ9NX55 129 aa32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.31■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.29■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.29■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP10DQ9P241 1426 aa32.28■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC30Q5VVM6 783 aa32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 SUSD4Q5VX71 490 aa32.27■■■□□ 2.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.762e-8■■□□□ 12.4
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 NYXQ9GZU5 481 aa32.25■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGA2Q08379 1002 aa32.24■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.24■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.24■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ERFEQ4G0M1 354 aa32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL6Q8N841 843 aa32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 PLBD2Q8NHP8 589 aa32.23■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 TCIRG1Q13488 830 aa32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF428Q96B54 188 aa32.22■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 PARP10Q53GL7 1025 aa32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF521Q96K83 1311 aa32.2■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 NTSR2O95665 410 aa32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 SRGNP10124 158 aa32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 STK31Q9BXU1 1019 aa32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.18■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC12Q96J65 1359 aa32.18■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 NLRP10Q86W26 655 aa32.17■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 MASTLQ96GX5 879 aa32.17■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa32.16■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.16■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 VAMP4O75379 141 aa32.15■■■□□ 2.74
HTATSF1-202ENST00000425695 STYK1Q6J9G0 422 aa32.15■■■□□ 2.74
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